Extração de DNA de Catasetum gladiatorium K. G. Lacerda (Orchidaceae) para uso em estudos moleculares

Auteurs-es

  • Kelli Évelin Müller Zortéa Universidade do Estado de Mato Grosso - UNEMAT
  • Géssica Tais Zanetti Universidade do Estado de Mato Grosso
  • Marta Helena Schorn de Souza Universidade do Estado de Mato Grosso
  • Guilherme Ferreira Pena Universidade do Estado de Mato Grosso
  • Ana Aparecida Bandini Rossi Universidade do Estado de Mato Grosso

Mots-clés :

Orquídea, CTAB, nitrogênio líquido, STE.

Résumé

Catasetum gladiatorium é endêmica do Brasil e localiza-se em regiões com perturbações ambientais que podem afetar sua diversidade genética. Análises de diversidade genética necessitam de DNA integro, obtido por meio de protocolos de extração rápidos e eficientes. Este estudo objetivou propor um protocolo eficiente para a extração de DNA de C. gladiatorium, para uso em futuras análises moleculares. O DNA foi extraído do tecido foliar com oito protocolos baseados no método CTAB. Testou-se o tipo de trituração do material vegetal (com tampão STE e nitrogênio líquido) e a concentração de CTAB (2% e 5%) e de β-mercaptoetanol (0% e 2%) no tampão de extração. O DNA extraído foi submetido a amplificação com dois primers ISSR. Os métodos de trituração do material vegetal influenciaram na qualidade e quantidade de DNA extraído de C. gladiatorium. A trituração com nitrogênio líquido permitiu a extração de DNA de boa qualidade em todas as demais variações dos protocolos testados, enquanto a trituração com STE possibilitou a extração de DNA com baixa concentração e alta taxa de degradação. Melhores resultados foram obtidos com CTAB à 5%. A ausência de β-mercaptoetanol não influenciou a qualidade do DNA extraído. A amplificação via PCR, demonstrou que o DNA extraído com base nos oito protocolos testados foi passível de amplificação utilizando os dois marcadores ISSR selecionados. Os oito protocolos de extração testados foram capazes de extrair DNA passível de amplificação de C. gladiatorium, e podem ser indicados para futuros estudos moleculares da espécie.

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Publié-e

2020-01-02

Comment citer

Müller Zortéa, K. Évelin, Zanetti, G. T., Schorn de Souza, M. H., Pena, G. F., & Rossi, A. A. B. (2020). Extração de DNA de Catasetum gladiatorium K. G. Lacerda (Orchidaceae) para uso em estudos moleculares. Revista Brasileira De Biociências, 17(2). Consulté à l’adresse https://seer.ufrgs.br/index.php/rbrasbioci/article/view/114577

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