Phylogenetic grouping based on triplex PCR of multiresistant Escherichia coli of environmental, human and animal origin

Abstract

A Escherichia coli é largamente utilizada como um indicador biológico de contaminação fecal devido à sua ubiquidade em fezes, no entanto, possui também a capacidade de persistir e multiplicar em ambientes fora do seu habitat primário. Membros da microbiota comensal, tais como E. coli, sofrem pressão seletiva pela sua exposição a agentes antimicrobianos, resultando no aumento de cepas resistentes. Este estudo teve como objetivo realizar uma determinação filogenética através do método de PCR triplex de cepas de E. coli multirresistentes provenientes de amostras ambientais, animais e humanas. As cepas de origem animal e humana foram associados a um perfil de multirresistencia mais amplo e à produção de ESBL. A determinação filogenética demonstrou que os filogrupos B1 (49%) e A (34%) foram os mais prevalentes e os filogrupos D (11%) e B2 (6%), os menos representativos. Os filogrupos A e B1, também foram relacionados a um perfil de multiresistencia mais significativo. Os resultados indicaram que os isolados deste estudo são associados a microbiota comensal de humanos e animais e que estas populações sofreram exposição a antimicrobianos de amplo espectro.